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留抵退稅，無論是自查還是檢查，可關注以下常見的三大類45個風險點：
行業及劃型問題
1.對照《中小企業劃型標準規定》或《金融業企業劃型標準規定》標準劃分企業類型出現錯誤
2.判定是否屬于制造業等六個行業出現錯誤
3.行業劃分時銷售額的比重計算錯誤
4.計算銷售額的比重時沒有包括稽查查補銷售額
5.計算銷售額的比重時沒有包括未開票收入計入
6.計算銷售額的比重時沒有包括視同銷售額收入計入
7.計算銷售額的比重時按照差額前的銷售額確定
8.計算銷售額的比重時收入口徑錯誤其他情形
收入及銷項稅額問題
9.是否通過個人賬戶收款不申報隱匿銷售收入
10.是否存在現金收入不按規定入賬的情形
11.是否存在未開具發票不按規定入賬的情形
12.向購貨方收取的各種價外費用（如違約金、法院判決應支付貨款利息等）是否全部按規定計算了銷項稅額。
13.是否存在不按規定的時間確認收入（如不動產租賃預收租賃費）
14.是否存在以貨易貨、以貨/不動產抵債收入未記收入的情形
15.是否存在無形資產/貨物/不動產投資未記收入的情形
16.是否將應收取的銷售款項，先支付費用（如委托代銷商品的手續費等），再將余款入賬作收入的情形
17.銷售購進的水、電未計算繳納增值稅（不含代收代付情形）
18.是否存在轉讓股票等金融產品未按規定計算申報增值稅的情形
19.對逾期未收回的包裝物押金是否按規定計提銷項稅額
20.是否存在擅自擴大免稅范圍的情形
21.是否存在取得財政補貼屬于增值稅應稅收入未按規定申報增值稅的情形
22.是否存在視同銷售行為、未按規定計提銷項稅額的情形（如將購進貨物無償贈送其他單位或者個人未視同銷售貨物計算繳納增值稅等）
23.處置自己使用過的固定資產存在一般計稅方法和簡易計稅的計稅方法選錯情形
24.是否存在不符合差額征稅規定，而按照差額征稅方法計算增值稅的情形
25.未開具發票銷售額填報負數且無正當理由
26.是否存在開具不符合規定的紅字發票沖減應稅收入的情形
27.增值稅申報收入與企業所得稅申報收入、財務報表收入不一致且無正當理由
28.是否存在混合銷售或兼營業務認定錯誤，未按規定進行核算
29.是否同時適用簡易計稅和一般計稅方法的業務但未分開核算，計稅方法混淆不清
30.按照增值稅稅法規定應征收增值稅的代購貨物、代理進口貨物的行為，是否繳納了增值稅
進項稅額問題
31.是否存在取得虛開的增值稅發票用于抵扣進項稅額的情形
32.是否存在購進的貸款服務、餐飲服務、居民日常服務和娛樂服務抵扣了進項稅額的情形
33.是否存在用于非增值稅應稅項目、免征增值稅項目、集體福利和個人消費抵扣進項情形
34.是否存在未按規定開具農產品收購統一發票申報抵扣進項稅額的情形
35.用于抵扣進項稅額的海關進口增值稅專用繳款書是否真實合法
36.取得完稅憑證抵扣進項稅額的，是否具備書面合同、付款證明和境外單位的對賬單或者發票等資料
37.是否存在取得橋、閘等通行費發票計算錯誤抵扣進項稅額的情形
38.是否存在取得應寫備注欄未寫備注欄等不合規抵扣憑證用于抵扣的情形
39.是否存在取得為非雇員支付的旅客運輸費用用于抵扣的情形
40.是否存在取得旅客運輸費用計算錯誤抵扣進項稅額的情形
41.發生退貨或取得銷售折讓是否按規定作進項稅額轉出
42.兼營免稅項目，其不予抵扣的進項稅額計算是否準確
43.兼營簡易計稅項目，其不予抵扣的進項稅額計算是否準確
44.已抵扣進項稅額的不動產改變用途不得抵扣時未按規定計算扣減不得抵扣的進項稅額。
45.是否存在其他扣稅憑證申報錯誤影響進項構成比例計算的情形
